Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTLL13PA6NNM8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL13PA6NNM8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms