Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP73A6NFT4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms