Protein–RNA interactions for Protein: A6NF01

POM121B, Putative nuclear envelope pore membrane protein POM 121B, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121BA6NF01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POM121BA6NF01 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
POM121BA6NF01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POM121BA6NF01 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms