Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP17L3A6NCW0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP17L3A6NCW0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP17L3A6NCW0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L3A6NCW0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L3A6NCW0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L3A6NCW0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms