Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC13A5PLN9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC13A5PLN9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms