Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
POTEFA5A3E0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POTEFA5A3E0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
POTEFA5A3E0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEFA5A3E0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEFA5A3E0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEFA5A3E0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POTEFA5A3E0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms