Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms