Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX2A2RU54 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms