Protein–RNA interactions for Protein: A0AV02

SLC12A8, Solute carrier family 12 member 8, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8A0AV02 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A8A0AV02 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A8A0AV02 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC12A8A0AV02 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC12A8A0AV02 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC12A8A0AV02 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms