Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GV72

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GV72 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A1B0GV72 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A1B0GV72 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms