Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0U1RQF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQF3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms