Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A087X1B8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A087X1B8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms