Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AFG3L2Q9Y4W6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms