Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5BQ9UGL1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms