Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms