Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms