Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC3GQ9HC16 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms