Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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