Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ROPN1BQ9BZX4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms