Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms