Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms