Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PITX2Q99697 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms