Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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