Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms