Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EDAQ92838 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EDAQ92838 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms