Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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