Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAL3Q7RTP6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms