Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms