Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms