Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PKDCCQ504Y2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms