Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUSP28Q4G0W2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms