Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms