Protein–RNA interactions for Protein: Q14746

COG2, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG2Q14746 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG2Q14746 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COG2Q14746 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COG2Q14746 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms