Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms