Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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PKP1Q13835 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP1Q13835 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PKP1Q13835 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PKP1Q13835 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PKP1Q13835 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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