Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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