Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms