Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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