Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF4Q08170 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms