Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms