Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNC1Q01954 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNC1Q01954 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNC1Q01954 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNC1Q01954 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms