Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3AP98173 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 434.9 ms