Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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