Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms