Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB28P51157 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB28P51157 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB28P51157 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB28P51157 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB28P51157 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB28P51157 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB28P51157 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB28P51157 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB28P51157 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB28P51157 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB28P51157 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB28P51157 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB28P51157 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB28P51157 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB28P51157 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms