Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPIAP49247 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPIAP49247 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPIAP49247 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms