Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX1P48742 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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