Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP5P45974 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP5P45974 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP5P45974 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP5P45974 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP5P45974 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP5P45974 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP5P45974 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms