Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCG1P45844 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms