Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELK3P41970 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELK3P41970 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELK3P41970 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELK3P41970 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELK3P41970 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELK3P41970 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELK3P41970 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms